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2019-05-09 13:11:53 专家推荐68℃

  454 Life Sciences推出用于高通量测序的新GS FLX +系统

  2011年6月28日

  454生命科学,罗氏公司(SWX:RO)(SWX:ROG)(粉单市场:RHHBY),今天宣布推出新的GS FLX +系统,该仪器能够产生超长的测序读数, 1000个长度。这一新的性能水平是生命科学行业的一个重要里程碑,使其成为第一个通过读取提供数百万个碱基的高通量测序技术,其精确度和长度可与基于Sanger的方法相媲美。长度也转化为总吞吐量增加50%,有助于整体运行经济性并进一步降低大型基因组项目的成本。

   “我们的客户已经从测试期间进行的各种基因组测序和重测序项目的长读取中受益。测试和早期访问。我们期待系统的商业发布,并让我们的两台仪器全时运行以满足需求。“早期用户的热情反馈证明了基因组分析中长读取的价值。早期访问项目揭示了扩展读取长度对包括de novo seq在内的各种应用的至关重要性全基因组的整理和组装,全面的转录组分析,环境样品的宏基因组鉴定等。发现长而准确的读数对于解析复杂基因组内的高度重复区域特别有效,导致组装显着改善。 “我们对我们实验室中GS FLX +系统的性能感到非常兴奋,”伊利诺伊大学厄本那 - 香槟分校高通量测序和基因分型部助理主任Chris Wright说。 “我们的客户已经从在beta测试和早期访问期间进行的各种基因组测序和重测序项目的长读取中受益。我们期待系统的商业发布,并让我们的两台仪器全时运行以满足需求。“该实验室主任Alvaro Hernandez补充说,他们的大部分工作涉及从非模型物种的基因组和转录组的从头测序。他解释说,“GS FLX +系统的非常长的读数允许基因及其剪接变体的精确组装,这仍然是短读技术的挑战”。宾夕法尼亚州立大学的研究人员已经使用超长读数来更好地描述极度濒危的塔斯马尼亚恶魔中的遗传多样性,这种物种受到被称为恶魔面部肿瘤疾病(DFTD)的传染性癌症的威胁。这项研究于本周在美国国家科学院院刊上发表,结合使用新的GS FLX +系统长读数,GS FLX Titanium配对末端读数和短读数据,对32亿碱基对基因组进行测序和组装。两个塔斯马尼亚恶魔,一个对一些DFTD菌株具有天然抗性,另一个在野外感染了这种疾病。相关故事研究发现使用薄荷脑香烟的遗传易感性治疗乳腺癌的药物可能有效治疗肺癌和卵巢癌的遗传变异与西班牙裔儿童中ALL风险较高相关的第四个基因“该项目的一个定义部分是能够在GS FLX +系统上产生长期,准确的读数,以便充分了解塔斯马尼亚恶魔的遗传构成,”宾夕法尼亚州立大学资深作者兼生物化学与分子生物学教授Stephan Schuster解释道。“ “长读”对于跨越重复元素并为这种独特物种建立全面和准确的基因组装配至关重要。比较基因组方法已被用于开发一个理论模型,以预测哪些塔斯马尼亚恶魔需要被圈养,以最大限度地保留物种生存的足够遗传多样性的机会。这种方法可能会扩展到其他濒危物种。新的GS FLX +系统可用作新仪器或现有GS FLX仪器的现场升级,并具有重新设计的试剂室,以适应新GS FLX Titanium测序试剂盒XL +的更大试剂量。测序流程周期数量的增加,以及化学和软件优化,使读取长度达到1,000 bp(700 bp模式)。该仪器还完全向后兼容现有的GS FLX Titanium测序套件XLR70。 “我们的团队不知疲倦地努力推动我们系统的性能,并实现真正类似Sanger的读取长度和准确度”。 454生命科学公司总裁兼首席执行官克里斯托弗麦克劳德说。 “我们的早期用户和整个生命科学界的反应非常积极。我们期待将此升级推广到我们的全球用户群,并继续展示长读序列的价值。来源: 罗氏

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